孩子清晨发烧是什么原因有多种，是因为细菌的感染引起清晨发热的现象，也会是因为系统性红斑狼疮、甲亢等疾病的出现。
1.细菌感染
当机体出现细菌感染时，机体内的免疫系统与细菌会发生反应，产生致热源或毒素，引起体温调节中枢出现改变并且毒素会扩散至全身，可以引起早上发热的症状。
2.系统性红斑狼疮
系统性红斑狼疮是机体出现免疫反应异常的症状，机体内的免疫系统攻击自己，致使免疫细胞破碎、裂解，产生，很多的内源性致热源，影响体温调节中枢引起发热。
3.甲亢
甲亢是指甲状腺功能亢进，甲状腺功能亢进会加快机体的活动，促进新陈代谢的发生，可以引起机体出现发热的症状。
若孩子出现清晨发烧的症状，长期未得到好转，或伴有其他症状时，应准时前往医院就医，明确缘由后给予针对性治疗。
